衛生部副部長兼國家中醫藥管理局局長畬靖在2005年全國中醫藥工作會議上強調，中醫藥行業要認真學習貫徹落實十六屆四中全會精神，全面落實科學發展觀，加快中醫藥的改革與發展。
畬靖說，黨的十六屆四中全會通過的《中共中央關于加強黨的執政能力建設的決定》，是全面推進黨的建設的強大思想武器，也是指導全黨擔當起執政興國歷史使命的綱領性文件。中醫藥行業要緊緊圍繞黨和國家的中心工作，服從服務于全面建設小康社會的大局，牢牢把握中醫藥工作的正確方向，切實維護廣大人民群眾的健康權益。在指導思想上，要堅持以鄧小平理論和“三個代表”重要思想為指導，樹立科學發展觀，繼承創新，深化改革，加快發展，更好地為人民健康服務，為全面建設小康社會服務。在發展目標上，要以滿足人民群眾對中醫藥服務的需求為導向，改革和完善中醫藥服務模式，做大做強中醫藥優勢，提高中醫藥對社會的貢獻率。在工作中，要全面落實黨的中醫藥方針政策，正確處理好繼承與發展的關系，促進中醫藥事業與衛生事業的協調發展、中醫與中藥的協調發展。
她說，要樹立全局觀念，拓寬服務領域，提高中醫藥對人民健康的貢獻率。目前，中醫藥作為我國衛生事業的優勢和特色，與現代醫學相互補充、相互合作，共同承擔著人民群眾的醫療衛生保健任務。改革開放25年來，我國衛生事業規模空前擴大，服務能力空前提高，但是仍然面臨應對處置突發公共衛生機制不健全、重大疾病流行蔓延等矛盾問題。全國有48.9%群眾有病不去就診，有29％應住院而不住院，群眾對“看病難”反映強烈。目前，全國正在開展城鄉公共衛生體系建設，提高突發公共衛生事件應急處置能力，加大重大疾病防治，加強農村衛生工作，開展城市醫療服務體制改革試點，逐步縮小醫療衛生服務差距。我們要樹立大局觀念，從維護人民群眾根本利益，滿足人民日益增長的健康需求高度，充分提高管理、協調中醫藥事業發展的能力，針對群眾急需解決的衛生問題，充分發揮中醫藥作用，提高中醫藥對人民健康的貢獻率。
要進一步轉變觀念，堅持以人為本，努力做到預防、治療、康復相結合，積極探索建立與此相適應的服務網絡。要堅持“有所為有所不為”的原則，在基本醫療、應對突發公共衛生事件、重大疾病防治、農村衛生工作、社區衛生服務、預防保健康復等方面選擇中醫藥發揮特色優勢的領域，組織隊伍，深入研究，大膽探索，擴大服務范圍，拓展服務領域。
佘靖說，要保持和發揚中醫藥特色與優勢，始終不渝地推進中醫藥繼承和發展。保持和發揚中醫藥特色與優勢是中醫藥事業發展的本質要求。改革開放以來，中醫藥隊伍不斷擴大，中醫醫療機構和規模不斷發展，中醫藥科技實力不斷增強，中醫藥事業在規模、數量上取得了前所未有的發展。但是，與中醫藥發展的規模、數量相比，發展的質量、效益還不高，中醫藥特色優勢沒有充分發揮，中醫臨床療效提高和學術發展相對緩慢。主要表現在三個方面，一是中醫醫療機構特別是在病房中醫藥的特色與優勢不突出；二是培養的中醫藥人才的中醫藥基礎理論不夠扎實，中醫臨床實踐能力不強；三是中醫藥科學研究突出中醫藥特色優勢不夠。
為了解決上述問題，我局于2001年提出了《關于進一步加強中醫藥繼承發展工作的意見》，明確了做好此項工作的指導思想、遵循的原則及主要任務和措施，并組織實施了一批重點項目，這對發揮中醫藥特色與優勢，提高中醫藥防病治病能力，促進中醫藥學術發展起到了一定的作用。但是中醫藥特色優勢不突出，繼承不足、創新不夠的問題，仍然是嚴重制約我們事業發展、學術發展的重要因素。因此，我們要充分認識突出中醫藥特色優勢，做好繼承發展工作的重要性、緊迫性和可能性，繼續貫徹落實《關于進一步加強中醫藥繼承發展工作的意見》，切實加強對這項工作的領導，加大工作力度，制定具體的工作計劃，精心組織實施。要認真總結近年來中醫藥繼承與發展工作，深入調查分析，科學論證，哪些做法可以肯定加以推廣，哪些做法需要改進完善，針對出現的新情況、新問題，研究提出新的對策和措施。要研究建立突出中醫藥特色優勢的評價方法，制定相應的規范、標準。客觀評價中醫藥的醫療服務、人才培養和科學研究工作，要認真研究中醫辦醫模式，正確處理好發揮特色優勢、運用中醫藥理論、診療方法與吸收現代科學包括現代醫學理論、診療方法的關系。要認真研究中醫藥科研的思路、技術路線和方法，正確處理好遵循科學研究的基本精神與體現中醫藥特點的關系。認真研究中醫藥人才培養的規律，積極探索傳統教育方式與現代教育的結合點。要正確處理繼承與發展的關系，認真繼承發揚中醫藥特色與優勢，勇于創新，積極利用現代科學技術，促進中醫藥理論與學術的發展。要堅持“百花齊放、百家爭鳴”的方針，創造民主和諧的學術研究氛圍；要加強中醫藥隊伍的團結，以開放兼容的態度，與所有立志為中醫藥事業發展貢獻力量的科技工作者共同研究探索，促進中醫藥理論學術發展。