環丙沙星系第三代氟喹諾酮類抗菌藥物，具有廣譜、抗菌作用強等特點，不過其毒副作用也應引起警惕。

環丙沙星的毒副作用有：

消化系統副作用

據國外資料表明，環丙沙星的胃腸反應發生率為2.8～5.7％，主要癥狀為惡心、嘔吐、腹痛、消化不良、厭食、吞咽困難、流涎、胃炎、食管炎、口腔炎及便秘等。消化系統的副作用大多于停藥后即消失，一般無需特殊處理。

泌尿系統副作用

環丙沙星治療泌尿系統感染效果較好，但用藥時間長則會引起明顯泌尿系統毒副作用，可能出現血尿、蛋白尿，重者可有一過性血尿素氮和肌酐升高。據資料表明，泌尿系統不良反應發生率在0.7％以下。個別有引起急性腎功能衰竭的報道，特別是兒童用藥后可能導致特異反應性腎功能衰竭，故兒童及腎功能不全患者慎用此藥。

血液系統副作用

極少數患者應用環丙沙星后可能出現粒細胞及血小板減少而嗜酸性粒細胞增高的現象。這種現象為時短暫，停藥后可恢復正常。長期應用環丙沙星時，個別人可因血小板降得過低而有出血現象，因此，長期用藥者應注意監測其凝血功能，以便及時處理。

骨骼系統副作用

兒童及青少年長期使用環丙沙星，可由于該藥對關節軟骨的損害而導致生長發育受阻，所以應限制將環丙沙星應用于兒童及青少年。環丙沙星還可引起患者關節痛、肌肉痙攣等，這些癥狀僅為一過性、可逆性改變，對癥處理或停藥即可緩解。

神經系統副作用

主要表現為中樞神經系統不良反應，如頭暈、頭痛、焦慮、嗜睡等現象，個別可致精神錯亂、幻覺等精神癥狀。對于環丙沙星引起的精神神經癥狀，輕者予以對癥處理，無需立即停藥，但對重癥者則需及時停藥，并且以后應當慎用。

內分泌系統副作用

極為少見，曾有乳液溢出和假性糖尿病的報道，原因不明，停藥后這些內分泌紊亂現象可很快消除。

過敏反應

極少數特異體質者可對環丙沙星產生過敏反應，以皮膚過敏癥狀為主，如皮膚潮紅、瘙癢、皮疹、紅斑、血管性水腫等，停藥后一周內過敏癥狀大都消退。個別患者可能出現光敏反應或嚴重過敏反應。光敏反應好發于女性，主要影響手背、腿、腳，以皮膚發熱、發紅、發癢、皰疹為主要癥狀，因而服藥期間應避免長時間暴露在日光下。嚴重過敏反應包括休克、哮喘、呼吸困難、喉頭水腫等，這類患者應禁止再次使用環丙沙星。