天然食物因營養損失少，不含化學添加劑而備受人們的青睞。可有些未經加工或烹調過的天然食物，存在一些能阻礙或抑制營養素吸收的成分，即抗營養因子。它們本身對人體并無毒害，但可通過對營養素的抑制和干擾，造成機體對某些營養素的吸收障礙，從而使人體出現營養缺乏癥。這些天然食物有以下三類：

含有蛋白酶抑制劑的食物

有些天然食物含有蛋白酶抑制劑，能抑制胃蛋白酶、胰蛋白酶、糜蛋白酶等多種蛋白酶對食物蛋白質的分解作用，使蛋白質不能被人體完全吸收。含有蛋白酶抑制劑的食物有兩種：一是豆類；二是生雞蛋。如果長期生食豆類或生雞蛋，就會引起營養不良。

影響維生素吸收的天然食物

維生素是維持身體健康必需的一種調節物質，在物質代謝中起重要作用。影響維生素吸收的天然食物也有兩類：一是某些水產品，如蝦、鮮魚等，含有硫胺素（維生素B1）酶，可使硫胺素失去活性，造成硫胺素缺乏，發生脂溢性皮炎、腳氣病等；二是生雞蛋，生雞蛋內的抗生物素蛋白可與生物素結合，使腸道不能吸收這種維生素，時間久了會產生皮炎、皮膚干燥、粗糙，出現脫屑性斑點等生物素缺乏癥。

影響礦物質吸收的天然食物

含有較多草酸的蔬菜（如菠菜、大蔥等）和大多數谷類食物，均可與鈣、鎂、鐵、鋅、銅等礦物元素結合，影響人體吸收。長期生食這些東西，會造成微量元素缺乏。